JASON 5.3
新機能のセットをリリースしました。AffinityScreenというプラグインが含まれており、現在ベータテストが可能です。今回のリリースでは、3D NMRサポートの改善、統計解析ツールの強化、そしてJASONユーザーのエクスペリエンス全体の向上も実現されています。 いくつかの新機能を下記にてご紹介します: 分析および統計ツール: フィッティングの結果には、相関係数R²とフィッティングの二乗平均平方根誤差(RMSE)が含まれるようになりました。 ピークフィッティングルーティンを拡充し、重なり合うピークをより正確にフィッティングする新ルーティンを導入しました。この高度な新ルーティンを試すには、設定パラメータ「精密リファイメントの上限ピーク数」を調整してください。これにより同時にフィッティングする重なりピーク数を設定できます。従来の1D NMRスペクトル全体のピークを対象とした高速フィッティングルーティンも引き続きご利用いただけます。 新プラグイン:AffinityScreen 長期間の開発を経て、AffinityScreenのベータテストを始動できることを嬉しく思います。本ツールは、時に複雑になりがちなリガンドスクリーニングデータの1D解析を簡素化し、他に類を見ない柔軟性を提供します。 [...]
JASON 5.1が登場
JASON5.1は、qNMR、固体NMR、オートメーション、日常的なNMR処理、解析、レポート作成など、JASONの使用目的が何であれ、新機能が満載です! 新機能の全リストはこちらをご覧ください。 まずはプラグインから見てみましょう: SolidSpin JASON 5.1は、新しい固体NMRシミュレーション・プラグイン:SolidSpinを搭載しています。 よく知られたシミュレーション・プログラムであるSIMPSONを使って、JASON内で固体NMRスペクトルのシミュレーションができるようになりました。 このシミュレーションを使って、実験スペクトルをフィッティングすることができます。カスタマイズが必要な場合はカスタムスクリプトを使用して、ユーザー指定の新しいシミュレーションを簡単に導入することができます。 SolidSpinプラグインは、有効なJASONライセンスを持っている全てのユーザーが無料で利用でき、プラグインマネージャーからインストールできます。 今すぐ試して、感想を聞かせてください。 [...]
JASONによるオートメーション入門
最近の投稿 BeautifulJASONによるバッチ処理 - JEOL JASON , において、JASONとpythonパッケージBeautifulJASONを使って、NMRデータ処理を自動化する方法について説明しました。このブログでは、一歩離れて、コマンドラインから直接JASONを呼び出すだけで利用できる簡単な自動化機能のいくつかを紹介します。 環境の設定 コマンドラインからJASONを簡単に使用するには、JASON実行ファイルの場所をパスに追加する必要があります。Windows上では、コントロールパネルからシステム環境編集の編集を開きpath変数を編集し、macOS上では、PATH環境変数にJASONを追加するか、 [...]
JASONバージョン5.0のご紹介
2025年のJASON 5.0へようこそ! 2025年を迎えるにあたり、JASONは新しいバージョン番号システムを導入しました。年間を通して、リリースの内容や間隔に変更はありません。以下はその説明です: 分子構造: JASONバージョン5.0では、分子構造作成エンジンが強化されました!明示的に分子内の水素の追加/削除ができるようになりました、平坦な2D分子を3Dに変換する, SMILESとInChI表現から分子を作成する, ChemDrawファイルの読み込みなど。リンク先のビデオで、その方法をご覧ください。 [...]
BeautifulJASONによる品質管理:スチレンブタジエンゴムの自動分析
品質管理で一般的に必要とされる同じ種類のサンプルの繰り返し分析は、面倒で時間がかかります。BeautifulJASONは、これらの作業を完全に自動化できるほど高速化するフレームワークを提供します。スチレンブタジエンゴム(SBR)のサンプル例で説明します。 SBRは最も広く使用されている合成ゴムで、ブタジエンとスチレンの共重合によって製造できます。スチレン/ブタジエンの比率はポリマーの特性に影響し、スチレン含有量が高いほど、ゴムは硬くなり、ゴムらしさが失われるます。したがって、この共重合体の組成を評価することが重要であり、NMRはこの作業に適しています。実際、ISO 21561-1には、溶液重合SBR中のブタジエンの微細構造とスチレンの含有量をプロトンNMRで定量的に決定する手順が説明されています。これは、図1および表1に示すように、SBRスペクトルから積分を抽出することを採用しています。 図1:SBR試料と積分範囲の例 表1: 信号統合エリアの定義 積分Cには溶媒も含まれるため、この方法ではブランクサンプルの溶媒の積分を取得し、積分Cから差し引くことを提案しています: そして、ブタジエン部分の各微細構造成分(トランス、シス、ビニル)の含有量とスチレン含有量は、以下のように計算されます: BeautifulJASONでは、このすべてを自動化することができます。スクリプトを実行するだけで自動的に積分して含量を計算し、レポートを生成することができます: これを行うにはまず積分範囲を定義する必要があります。この場合、自動積分ではなく手動積分を実施します。JASONでデータセットを開き、iキーを押します(または、選択したスペクトルの左上にあるコンテキストツールバーの積分モードボタンを左クリックする)。次にマウスの左ボタンを押したまま、カーソルを水平にドラッグ&ドロップして積分領域を定義し、関心のある領域を積分します。これを各積分領域で繰り返します。積分バーをダブルクリックすると、積分プロパティダイアログが開き、積分領域をより正確に定義することができます。 [...]
BeautifulJASONによるバッチ処理
大量のデータを扱うことは、プロセス開発からメタボロミクスまで、幅広いNMRアプリケーションで直面します。これらのスペクトルから必要な情報をいかに効率的に抽出するかは非常に重要です。このブログでは、BeautifulJASON pythonパッケージを使用して、データのディレクトリ全体を迅速に統合し、それらの積分結果をテキストファイルに抽出してさらに下流で処理する方法を説明します。 Beautiful JASONのインストール この記事のステップを実行するには、JASONのコピーとBeautifulJASON pythonパッケージが必要です。後者はpipを使って以下のコマンドでインストールできます: pip install beautifuljason [...]